Sau khi được cả hai huấn luyện viên của Maroc và Hà Lan lựa chọn vào ĐT, Anh đã bị rơi vào tình thế khó xử với việc thi đấu cho ĐT Maroc, bởi nguồn gốc Moroc của anh, hay là thi đấu cho ĐT Hà Lan, nơi mà anh sinh sống. Cuối cùng thì anh đã lựa chọn ĐT Hà Lan bất chấp việc phải cạnh tranh gay gắt cho vị trí ở hàng tiền vệ.[11] Anh có trận đấu quốc tế đầu tiên tại vòng loại Euro 2008 gặp Slovenia vào ngày 28 tháng 3 năm 2007. Ngày 12 tháng 10 năm 2010 Ibrahim Afellay ghi bàn thắng quốc tế đầu tiên của mình vào lưới Thụy Điển tại Vòng loại Euro 2012.

Euro 2008

Afellay được góp mặt trong đội hình của Marco van Basten tại Euro 2008 và thường được sử dụng trong vai trò dự bị. Chỉ vài giây sau khi vào thay Dirk Kuyt trong trận đấu vòng bảng gặp Italy Anh đã có cơ hội ghi được bàn thắng nhưng cú volley của anh, bóng lại đi vọt xà ngang. Trong trận đấu cuối vòng bảng gặp Romania, anh được trao 1 vị trí trong đội hình ra sân cùng với Arjen Robben trên hàng tiền vệ.

World Cup 2010

Afellay là thành viên của ĐT Hà Lan tham dự World Cup 2010.[12] Anh vào sân thay người trong 2 trận đầu của Hà Lan tại giải đấu, chiến thắng 2–0 trước Đan Mạch[13] và chiến thắng 1–0 trước Nhật Bản và với tỉ số tương tự như vậy ở vòng 16 đội gặp Slovakia.

Euro 2012

Ngày 12 tháng 10 năm 2010, Afellay có được bàn thắng đầu tiên cho đội tuyển Hà Lan với cú đúp trong chiến thắng 4-1 trước Thụy Điển tại vòng loại Euro 2012.[14] Mặc dù bị dính chấn thương trong phần lớn mùa giải 2011–12, anh vẫn có tên trong đội hình tham dự Euro 2012 của Hà Lan. Ngày 2 tháng 6 năm 2012, Afellay lập cú đúp trong trận giao hữu thắng 6–0 trước Bắc Ireland, đó cũng là trận đấu cuối của Hà Lan trước khi Euro khởi tranh.

Tại giải đấu này, anh được ra sân trong hai trận đấu của Hà Lan tại vòng bảng Euro 2012 thua Đan Mạch và Đức.

Euro 2016

Ở vòng loại Euro 2016, anh chỉ ghi được một bàn thắng trong trận Hà Lan thắng Kazakhstan với tỉ số 3–1. Tuy nhiên Hà Lan không thể góp mặt ở Euro 2016 do chỉ xếp thứ tư chung cuộc với 13 điểm, 4 trận thắng, 1 trận hòa và 5 trận thua.